[{"data":1,"prerenderedAt":-1},["ShallowReactive",2],{"$fPsdZbhA75H9Yj7EPoZvFuQSIk7nergtTJ105I_bRjf4":3},{"data":4},{"_id":5,"title":6,"slug":7,"description":8,"pdfs":9,"section":10,"photo":54,"platforms":55,"tags":57,"publish":63,"createdAt":64,"updatedAt":65,"revised":63},"691dc434fbcd6472f066b3ed","Les différents types de séquençage","les-diffrents-types-de-squenage","\u003Cp class=\"ql-align-center\">\u003Cspan class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 41, 102); background-color: rgb(204, 224, 245);\">Le séquençage est devenu l’un des outils les plus utilisés dans la recherche scientifique moderne. Même si la technologie peut sembler complexe, son objectif est simple : lire l’information contenue dans l’ADN ou l’ARN.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp class=\"ql-align-center\">\u003Cspan class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 41, 102); background-color: rgb(204, 224, 245);\">Aujourd’hui, plusieurs approches existent, chacune avec ses avantages, ses usages et son niveau de précision.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>",[],[11,18,24,30,36,42,48],{"title":12,"content":13,"order":14,"products":15,"photo":16,"_id":17},"Le séquençage Sanger","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le séquençage Sanger est souvent présenté comme la “méthode historique”.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">C’est une technologie robuste, encore utilisée pour :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Vérifier une séquence courte.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Valider un produit PCR.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Confirmer une mutation ciblée.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Cette méthode lit l’ADN base par base sur une petite longueur. Elle est simple, fiable et pratique lorsqu’on ne cherche pas à analyser de grands génomes.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">C’est aussi l’une des technologies les plus accessibles pour débuter dans le séquençage.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cstrong class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 71, 178);\">\u003Cem>Principe : \u003C\u002Fem>\u003C\u002Fstrong>\u003Ca href=\"https:\u002F\u002Fwww.sciencedirect.com\u002Ftopics\u002Fneuroscience\u002Fsanger-sequencing\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\" class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 71, 178);\">ScienceDirecte\u003C\u002Fa>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le séquençage Sanger utilise des fragments d’ADN et des “bloqueurs” spéciaux qui stoppent la réplication à différents endroits. Chaque arrêt permet d’obtenir des fragments de tailles différentes, lus ensuite pour reconstituer la séquence.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Ca href=\"https:\u002F\u002Fwww.researchgate.net\u002Fpublication\u002F357155980\u002Ffigure\u002Ffig1\u002FAS:1102688062316544@1639912729285\u002FSanger-sequencing-process-A-Genome-DNA-is-cut-into-different-DNA-fragments-by.png\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\">\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dc502bdf6be4a19861127\u002Fimage_1763558658404_y9g8yy8u3ea.png\">\u003C\u002Fa>\u003C\u002Fp>","1",[],null,"691dc502bdf6be4a19861127",{"title":19,"content":20,"order":21,"products":22,"photo":16,"_id":23},"Le séquençage NGS (Next-Generation Sequencing)","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le NGS a transformé la biologie moderne.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Il permet de séquencer des millions de fragments simultanément, ce qui apporte une énorme puissance d’analyse.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Les avantages principaux :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Obtenir des données en grande quantité.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Explorer plusieurs régions génétiques en un seul run.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Analyser des échantillons complexes comme le microbiome ou l’ARN.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Grâce au NGS, il est possible de réaliser des projets qui auraient été impossibles avec la méthode Sanger : séquençage du génome complet, panels de gènes, transcriptomique, variants multiples, etc.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cstrong class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 71, 178);\">\u003Cem>Principe \u003C\u002Fem>: \u003C\u002Fstrong>\u003Cem class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 71, 178);\">\u003Ca href=\"https:\u002F\u002Fwww.sciencedirect.com\u002Ftopics\u002Fmedicine-and-dentistry\u002Fnext-generation-sequencing\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\">ScienceDirecte\u003C\u002Fa>\u003C\u002Fem>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le NGS fragmente l’ADN ou l’ARN en milliers voire millions de petits morceaux. Chaque fragment est ensuite amplifié, lu en parallèle et assemblé informatiquement pour reconstruire la séquence complète.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Ca href=\"https:\u002F\u002Fwww.researchgate.net\u002Fpublication\u002F383940409\u002Ffigure\u002Ffig1\u002FAS:11431281277432276@1726045059859\u002FOverview-of-next-generation-sequencing-NGS-process-Amplicon-based-methods-include-the.png\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\">\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dc5d9d8f44cc6ca8fd9a4\u002Fimage_1763558873145_or6mkh51vc.png\">\u003C\u002Fa>\u003C\u002Fp>","2",[],"691dc5d9d8f44cc6ca8fd9a4",{"title":25,"content":26,"order":27,"products":28,"photo":16,"_id":29},"Le Whole Genome Sequencing (WGS)","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le WGS permet de lire 100 % du matériel génétique présent dans un organisme. Cela inclut :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Les gènes.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Les régions non codantes.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Les variations structurelles.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Les zones habituellement difficiles à analyser.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Cette approche est idéale lorsque l’on veut obtenir une vision globale, par exemple pour étudier l’évolution, caractériser une souche, ou explorer la diversité génétique d’un organisme.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cstrong class=\"ql-size-large\" style=\"color: rgb(0, 71, 178);\">\u003Cem>Principe :\u003C\u002Fem>\u003C\u002Fstrong>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le génome est découpé en multiples fragments. Chaque fragment est séquencé, puis les morceaux sont assemblés pour obtenir une vision complète de l’ADN d’un organisme.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Ca href=\"https:\u002F\u002Fars.els-cdn.com\u002Fcontent\u002Fimage\u002F3-s2.0-B978012813764200012X-f12-01-9780128137642.jpg\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\">\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dc672bdf6be4a19861420\u002Fimage_1763559026464_r8z05kcjztl.png\">\u003C\u002Fa>\u003C\u002Fp>","3",[],"691dc672bdf6be4a19861420",{"title":31,"content":32,"order":33,"products":34,"photo":16,"_id":35},"Le Whole Exome Sequencing (WES)","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Contrairement au WGS, le WES se concentre uniquement sur l’exome, c’est-à-dire les régions codantes (environ 1 à 2 % du génome).\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">C’est une méthode très utilisée car :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Elle génère moins de données à analyser.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Elle cible directement les zones qui influencent la production de protéines.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Elle est plus rapide et plus économique que le WGS.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le WES est souvent choisi lorsqu’on cherche à comprendre des variations dans la partie “fonctionnelle” du génome.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cstrong style=\"color: rgb(0, 71, 178);\" class=\"ql-size-large\">\u003Cem>Principe :\u003C\u002Fem>\u003C\u002Fstrong>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le WES capture uniquement les exons (zones codantes) grâce à des sondes spécifiques. Ces zones sont ensuite séquencées avec la technologie NGS.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Ca href=\"https:\u002F\u002Fwww.researchgate.net\u002Fpublication\u002F336414538\u002Ffigure\u002Ffig2\u002FAS:11431281244189188@1715881717071\u002FGeneralized-workflow-of-whole-exome-sequencing-The-first-step-is-obtaining-DNA-of.png\" rel=\"noopener noreferrer\" target=\"_blank\">\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dc737df82dfcef4ad4d54\u002Fimage_1763559223654_faxb4bw2fl.png\">\u003C\u002Fa>\u003C\u002Fp>","4",[],"691dc737df82dfcef4ad4d54",{"title":37,"content":38,"order":39,"products":40,"photo":16,"_id":41},"Le RNA-seq","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le RNA-seq permet de mesurer l’expression des gènes. Plutôt que de lire l’ADN, cette méthode lit l’ARN pour savoir :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Quels gènes sont activés.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-A quel niveau ils sont exprimés.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Comment les cellules réagissent à un stimulus.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Le RNA-seq est devenu incontournable dans la recherche en biologie cellulaire et en études fonctionnelles.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Ch3>\u003Cstrong style=\"color: rgb(0, 71, 178);\" class=\"ql-size-large\">\u003Cem>Principe :\u003C\u002Fem>\u003C\u002Fstrong>\u003C\u002Fh3>\u003Ch3>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">L’ARN est d’abord transformé en ADN complémentaire (cDNA), puis les fragments sont séquencés comme dans le NGS pour mesurer quels gènes sont exprimés et à quel niveau.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fh3>\u003Cp>\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dc81ec58def152c718069\u002Fimage_1763559454511_mxqorjucuml.png\">\u003C\u002Fp>","5",[],"691dc81ec58def152c718069",{"title":43,"content":44,"order":45,"products":46,"photo":16,"_id":47},"Le séquençage long read","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Les plateformes modernes permettent de lire de très longues séquences. Elles sont utiles pour :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">- Assembler des génomes complexes.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Détecter des grandes variations.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Analyser des régions répétitives.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Ce type de séquençage complète très bien le NGS classique, car il apporte une vision “continue” de l’ADN.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cstrong style=\"color: rgb(0, 71, 178);\" class=\"ql-size-large\">\u003Cem>Principe :\u003C\u002Fem>\u003C\u002Fstrong>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Contrairement au NGS classique (fragments courts), les technologies long-read lisent de très longues molécules en continu. Elles permettent d’obtenir une vision plus complète des régions difficiles.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dc93939e60c2f82ec331d\u002Fimage_1763559737367_9a24rsaulmf.png\">\u003C\u002Fp>","6",[],"691dc93939e60c2f82ec331d",{"title":49,"content":50,"order":51,"products":52,"photo":16,"_id":53},"Le targeted sequencing","\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Lorsqu’on ne souhaite analyser qu’un groupe de gènes ou une région donnée, on utilise le séquençage ciblé. Il est apprécié pour :\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Sa précision.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Son coût réduit.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">-Sa facilité d’interprétation.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Il est souvent utilisé dans des panels spécifiques (métabolisme, immunologie, virologie, etc.).\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cstrong style=\"color: rgb(0, 71, 178);\" class=\"ql-size-large\">\u003Cem>Principe :\u003C\u002Fem>\u003C\u002Fstrong>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cspan class=\"ql-size-large\">Cette approche utilise des sondes ou amorces pour sélectionner uniquement une région précise (panel de gènes, exons spécifiques, loci). Une fois la zone capturée, elle est séquencée par NGS ou Sanger.\u003C\u002Fspan>\u003C\u002Fp>\u003Cp>\u003Cimg src=\"https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002F691dca66d8f44cc6ca8fe308\u002Fimage_1763560038751_ll95c32o9gc.png\">\u003C\u002Fp>","7",[],"691dca66d8f44cc6ca8fe308","https:\u002F\u002Fcdn.gentaur.com\u002Fblogs\u002F691dc434fbcd6472f066b3ed\u002Fphotos\u002Fcover\u002F-genetic-data-.webp",[56],"genprice.fr",[58,59,31,25,60,61,62],"Séquençage","Séquençage Sanger","NA-seq","Séquençage Long Read","Targeted Sequencing",true,"2025-11-19T13:20:52.730Z","2025-11-19T13:55:12.107Z"]